Na ulici Žižkova v budově Z Fakulty stavební má ústav k dispozici dvě plnohodnotně vybavené laboratoře určené pro výuku i výzkum:
Laboratoř pitné vody
Umístění: učebna Z311
Zaměření: monitoring a analýzy kvality pitné vody, ověřování technologií úpravy, podpora praxe (vodárenské společnosti, obce).
Laboratoř odpadní vody
Umístění: učebna Z061
Zaměření: zkoumání odpadních vod, simulace stokových sítí, testování technologií čištění a hodnocení vlivu na recipienty.
Laboratoře Centrum AdMaS
Umístění: Purkyňova 139, budova P4
Zaměření: chemické laboratoře a laboratoř reuse technologií a diagnostiky
